Přejít k hlavnímu obsahu

Genomika a cirkulující biomarkery

Laboratoř experimentální medicíny
Seniorská výzkumná skupina

Výzkum se zaměřuje na zavádění komplexních genomických analýz tekuté biopsie (cirkulující nádorové buňky, cirkulující nádorová DNA, extracelulární vezikuly, volné cirkulující biomarkery) do diagnostiky, sledování a léčby onkologických pacientů. Minimální invazivita a možnost opakovaných odběrů tekuté biopsie poskytují přesné a aktuální informace o současném rozsahu onemocnění, účinku léčby nebo recidivě onemocnění, a umožňují tak cílenou léčbu ve správný čas. Členové skupiny se translačnímu výzkumu v oblasti tekuté biopsie nádorů věnují více než 15 let a zavedli několik diagnostických metod pro predikci diseminace a/nebo progrese nádorových onemocnění u člověka.

Oblasti výzkumu
  • Genomika nádorových onemocnění
  • Genová exprese a její regulace u nádorů
  • Tekutá biopsie
  • Cirkulující nádorové buňky
  • Vzácná onemocnění
Aktuální projekty

Optimalizace genomických metod v diagnostice nádorových onemocnění s využitím tekuté biopsie. Metodické postupy jsou zásadní pro práci s malým množstvím biologického materiálu a je třeba je optimalizovat. Zejména pro analýzu cirkulujících nádorových buněk a volné cirkulující nádorové DNA se jako klíčové pro vysokou kvalitu výsledků jeví kroky purifikace, amplifikace a přípravy knihoven. Validace nových cirkulujících biomarkerů. Hlavní oblastí výzkumu je identifikace a validace nových diagnostických, prognostických a prediktivních biomarkerů nádorových onemocnění s využitím neinvazivní tekuté biopsie. Skupina Dr. Srovnala se od roku 2005 zaměřuje na detekci cirkulujících nádorových buněk i plazmatických biomarkerů u kolorektálního karcinomu, karcinomu slinivky břišní, karcinomu prsu a karcinomu plic. V současnosti je v centru pozornosti vliv opioidních léčiv na diseminaci nádorů.

Vybrané publikace
SLAVÍK, H., V. BALIK, F. KOKAS, R. SLAVKOVSKÝ, J. VRBKOVÁ, A. ŘEHULKOVÁ, T. LAUSOVÁ, J. EHRMANN, S. GURSKÁ, I. ÜBERALL, M. HAJDÚCH, J. SROVNAL
Transcriptomic Profiling Revealed Lnc-GOLGA6A-1 as a Novel Prognostic Biomarker of Meningioma Recurrence. Neurosurgery. 2022, 91(2), 360-369, ISSN: 0148-396X, PMID: 35551164,
SLAVÍK, H., V. BALIK, F. KOKAS, R. SLAVKOVSKÝ, J. VRBKOVÁ, A. ŘEHULKOVÁ, T. LAUSOVÁ, J. EHRMANN, S. GURSKÁ, I. ÜBERALL, M. HAJDÚCH, J. SROVNAL
Transcriptomic Profiling Revealed Lnc-GOLGA6A-1 as a Novel Prognostic Biomarker of Meningioma Recurrence. Neurosurgery. 2022, 91(2), 360-369, ISSN: 0148-396X, PMID: 35551164,
KUDLOVÁ, N., H. SLAVÍK, P. DUŠKOVÁ, T. FÜRST, J. SROVNAL, J. BÁRTEK, M. MISTRÍK, M. HAJDÚCH
An efficient, non-invasive approach for in-vivo sampling of hair follicles: design and applications in monitoring DNA damage and aging. Aging. 2021, 13(23), 25004-25024, ISSN: 1945-4589, PMID: 34874896,